A metodologia do SPE – Sistema Positivo de Ensino, que se desenvolveu no Colégio Positivo, está concretizada no Livro Didático Integrado Positivo, no Portal do Colégio Positivo, nos projetos e nos eventos desenvolvidos pela instituição.

O material didático dá espaço para a criatividade dos professores e alunos durante as aulas, por meio da integração vertical e da integração horizontal. A integração vertical garante que os conteúdos de uma série deem continuidade aos da série anterior. A grande vantagem para o estudante é que ele aproveita integralmente todo o conteúdo previsto para a sua série, sem lacunas e repetições. A integração horizontal significa que o conteúdo de uma disciplina auxilia no aprendizado de outras disciplinas. É uma prática pedagógica inovadora, que ainda permite a interação dos livros com o Portal do Colégio Positivo. O Portal traz conteúdos exclusivos e recursos multimídia que ampliam e complementam o que está nos livros didáticos integrados.