O aprendizado nesse nível de ensino acontece por meio de aulas expositivas, saídas pedagógicas, aulas práticas em laboratórios modernos e projetos diferenciados, o que permite o aprendizado dinâmico e a consolidação do hábito de estudo.

O Ensino Fundamental II é a fase marcada pelo estímulo à criatividade. Para isso, a instituição propõe ampliar o conhecimento e aprofundar os conteúdos adquiridos no nível anterior, aprimorar as capacidades de comunicação e de interação, consolidar o hábito de estudo e promover a iniciação em projetos científicos, artísticos e esportivos.

O Ensino Fundamental II é oferecido no Colégio Positivo Júnior, no Colégio Positivo – Jardim Ambiental e no Colégio Positivo Internacional (até o 8º ano).